В ходе бомбежек городов Германии союзные самолеты старались летать как можно выше. В мае 1944 г. командование 1-й дивизии ПВО Берлина докладывало руководству: «При современной высоте налетов 7 - 8 км 8,8-см зенитные пушки обр. 36 и 37 исчерпали границы своей досягаемости». Поэтому срочно потребовались зенитные орудия, обладавшие большим потолком стрельбы.
В 1939 г. фирма «Райнметалл» получила контракт на создание нового орудия с улучшенными баллистическими характеристиками. Первоначально орудие именовалось Gerat 37. Это название было заменено в 1941 г. на 8,8-cm Flak 41, когда был изготовлен первый опытный образец орудия. Первые серийные образцы (44 штуки) были направлены в Африканский Корпус в августе 1942 г., причем половина их была потоплена в Средиземном море вместе с германским транспортом. Испытания оставшихся образцов выявили ряд трудноустранимых конструктивных недостатков.
С 1943 г. эти орудия стали поступать в ПВО рейха. В феврале 1944 г. в ПВО рейха было 279 орудий Flak-41.
Ствол пушек Flak 41 первоначально состоял из трёх частей - каморной, средней и дульной. В конце 1944 перешли на трубу-моноблок. Затвор полуавтоматический горизонтальный клиновой. Досылка патрона производилась гидропневматическим досылателем. Пушка имела электрогидравлические приводы горизонтального и вертикального наведения. Лафет пушки имел 4 крестообразные станины, опиравшиеся в боевом положении на грунт.
Всего для пушек Flak 41 было разработано 5 видов снарядов - 2 осколочно-фугасных с разными типами взрывателей и 3 бронебойных. Досягаемость орудия по высоте: баллистический потолок 15000 м, высота действительного огня - 10500 м. Бронепробиваемость бронебойно-трассирующим снарядом на дистанции 1000 м составляла 159 мм, а бронебойным подкалиберным - 192 мм.